初级药师的考试科目为基础知识、相关专业知识、专业知识和专业实践能力。每科满分为100分，资格标准一般除以满分的60%，即60分视为合格。
初级药师考试采取纸笔考试和人机对话考试两种形式。每科100题，都是选择题。选择题分为五种:A1、A2、A3、A4、B1。键入A1(单句最佳选择问题)，键入A2(案例总结最佳选择问题)，键入A3(案例组最佳选择问题)，键入A4(案例串最佳选择问题)，键入B1(标准兼容性问题)。